目錄第一冊　本草綱目　重刻本草綱目序　重刊本草綱目敘　進本草目疏　凡例　本草綱目總目　第一卷　序例上　　序例上目錄　　歷代諸家本草　　引據(jù)古今醫(yī)家書目　　采集諸家本草藥品總數(shù)　　《神農(nóng)本經(jīng)》名例　　陶隱居《名醫(yī)別錄》合藥分劑法則　　采藥分六氣歲物　　七方　　十劑　　氣味陰陽　　五味宜忌　　五味偏勝　　標本陰陽　　　　升降浮沉　　四時用藥例　　五運六滛用藥式　　六腑六臟用藥氣味補瀉　　五臟五味補瀉　　臟腑虛實標本用藥式　　引經(jīng)報使　第二卷　序例下　　序例下目錄　　藥名同異　　相須相使相畏相惡諸藥　　相反諸藥　　服藥食忌　　妊娠禁忌　　飲食禁忌　　李東垣隨證用藥凡例　　陳藏器諸虛用藥凡例　　張子和汗吐下三法　　病有八要六失六不治　　《藥對》歲物藥品　　《神農(nóng)本草經(jīng)》目錄　　宋本草舊目錄　第三卷　主治　　主治目錄　　百病主治藥上　　諸風　　痙風　　項強　　癲癇　　卒厥　　傷寒熱病　　瘟疫　　暑　　濕　　火熱　　諸氣　　痰飲　　脾胃　　吞酸嘈雜　　噎膈　　反胃　　　　嘔吐　　噦啘　　呃逆　　霍亂　　泄瀉　　痢　　瘧　　心下痞滿　　脹滿　　　諸腫　　黃疸　　腳氣　　痿　　轉(zhuǎn)筋　　喘逆　　咳嗽　　肺痿肺癰　　虛損　　瘵疰　　邪崇　　寒熱　　吐血衄血　　齒衄　　血汗　　咳嗽血　　諸汗　　怔忡　　健忘　　驚悸　　狂惑　　　煩躁　　不眠　　多眠　　消渴　　遺精夢泄　　赤白濁　　癃淋　　瘦數(shù)遺尿　　小便血　　陰痿　　強中　　囊癢　　大便燥結(jié)　　脫肛　　痔漏　　　　下血　　淤血　　積聚癥瘕　　諸蟲　　腸鳴　　心腹痛　　脅痛　　腰痛　　疝*　第四卷　主治　　主治目錄　　百病主治藥下　　痛風　　頭痛　　眩運　　眼目　　耳　　面　　鼻　　唇　　口舌　　咽喉　　音聲　　牙齒　　須發(fā)　　胡臭　　丹毒　　風瘙疹痱　　疬瘍癜風　　癭瘤疣痣　　瘰疬　　癰疽　　諸瘡上　　諸瘡下　　外傷諸瘡　　金、鏃、竹、木傷　　跌仆折傷　　五絕　　諸蟲傷　　 　第五卷　水部　第六卷　火部　第七卷　土部　第八卷　金石部　第九卷　石部　第十卷　石部　第十一卷　石部第二冊第三冊第四冊