鹽酸米諾環(huán)素主要用于立克次體病、支原體肺炎、淋巴肉芽腫、下疳、鼠疫、霍亂、布氏桿菌病（與鏈霉素聯(lián)合應(yīng)用）等。對大腸桿菌、產(chǎn)氣桿菌、
志賀桿菌、流感嗜血桿菌、克雷白桿菌等敏感菌株所致的系統(tǒng)或局部感染也可應(yīng)用。此外、對淋球菌、梅毒和雅司螺旋體、李司忒菌、
梭狀芽胞桿菌、炭疽桿菌、放線菌、梭桿菌所致感染，當(dāng)患者不耐青霉素時，可考慮用本品（或其他四環(huán)素類）。對于鏈球菌的敏感
菌株所致感染也可考慮用本品。
至于金黃色葡萄球菌則大部分菌株對本類藥物耐藥。此外，本品尚可用于阿米巴病的輔助治療。